基因的分離定律是一對等位基因的遺傳規律，描述的是等位基因分離的情況；而基因的自由組合定律則是兩對及兩對以上的等位基因間的遺傳規律，屬于非等位基因組合的情況。基因的分離定律是基因的自由組合定律的基礎，基因的自由組合定律中的每對等位等位基因都要相互分離，這些非等位基因才能進行自由組合。